Er is een betekenisverschil.

 

waternood

te weinig water
De hoge temperaturen droegen bij aan het ontstaan van de waternood.

 

watersnood

te veel water
Toen de dijken doorbraken was er direct sprake van een watersnood.

 

Kijk voor andere voorbeelden van (mogelijk) betekenisverschil in samenstellingen met een tussen-s bij beheersysteem / beheerssysteem.