Er is een betekenisverschil.

 

zei

verleden tijd van zeggen
Zei zij nu dat de winkel al dicht was?

 

zij

persoonlijk voornaamwoord enkelvoud vrouwelijk en meervoud; aanvoegende wijs van zijn
Het zij zo, zei zij.

 

De variatie ei-ij kent meer woordparen. Voor andere struikelblokken kijkt u bij bereiden / berijden.